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<!-- TOPDB (tm) Topology Database of Transmembrane Proteins -->
<!-- XML Schema Definition -->
<!-- June, 2005 -->
<!-- Version 3.0 -->
<!-- Copyright (c) 2005 - 2023 -->
<!-- Gabor E Tusnady -->
<!-- Institute of Enzymology, RCNS -->
<!-- ************************************************************* -->
<!-- Last modified:
$Date: 2023-08-11 09:49:24 +0200 (Sat, 11 Aug 2023) $
$Author: tusi $
$Rev: 153 $
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<xsd:element ref="Name" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
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<xsd:element ref="Sequence" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
<xsd:element ref="Topology" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
<xsd:element ref="Experiments" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
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<xsd:attribute name="ID" type="topdbID" use="required"/>
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<xsd:simpleType name="topdbID">
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<xsd:documentation>
TOPDB id can be a UniProt ID (like MRP1_HUMAN) or a PDB code with chain identifier (like 1afo_A)
</xsd:documentation>
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<xsd:restriction base="xsd:string">
<xsd:pattern value="[A-Z0-9]*_[A-Z0-9]*"/>
<xsd:pattern value="[1-9][a-zA-Z0-9][a-zA-Z0-9][a-zA-Z0-9]_[a-zA-Z0-9]"/>
<xsd:maxLength value="15"/>
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<xsd:element name="Name" type="xsd:string"/>
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<xsd:element ref="PDB" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/>
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<xsd:element name="PDB">
<xsd:annotation>
<xsd:documentation>
CrossRef/PDB is a crossreference to the corresponding PDB (Protein Data Bank) (http://www.rcsb.org/pdb) file(s). Becouse multiple PDB files have the same sequence, the number of CrossRef/PDB is unbounded.
</xsd:documentation>
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<xsd:element name="Resolution" type="pdbRes" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
<xsd:element name="Method" type="pdbMeth" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
<xsd:element name="Chains" type="pdbChains" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
<xsd:element ref="SideDefinition" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
</xsd:sequence>
<xsd:attribute name="ID" type="pdbID" use="required"/>
</xsd:complexType>
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<xsd:simpleType name="pdbID">
<xsd:annotation>
<xsd:documentation>
!IN PDB! HEADER record: column:63 - 66; Data type: IDcode; field: idCode; definition: This identifier is unique within PDB. PDB coordinate entry ID codes do not begin with 0, as this is used to identify the NOC files which are bibliographic only, not structural entries.
</xsd:documentation>
</xsd:annotation>
<xsd:restriction base="xsd:string">
<xsd:pattern value="[1-9][a-zA-Z0-9][a-zA-Z0-9][a-zA-Z0-9]"/>
</xsd:restriction>
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<xsd:simpleType name="pdbRes">
<xsd:annotation>
<xsd:documentation>
!IN PDB! The second REMARK 2 record has one of two formats. The first is used for diffraction studies, the second for other types of experiments in which resolution is not relevant, e.g., NMR and theoretical modeling. For diffraction experiments:1-6 Record name "REMARK";10 LString(1) "2";12-22 LString(11) "RESOLUTION.";23-27 Real(5.2) resolution Resolution;29-38 LString(10) "ANGSTROMS.". REMARK 2 when not a diffraction experiment: 1-6 Record name "REMARK"; 10 LString(1) "2";12-38 LString(28) "RESOLUTION. NOT APPLICABLE."; 41-70 String comment Comment.
</xsd:documentation>
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<xsd:restriction base="xsd:decimal">
<xsd:minExclusive value="0"/>
<xsd:maxExclusive value="50"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
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<xsd:restriction base="xsd:string">
<xsd:enumeration value="N/A"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
</xsd:union>
</xsd:simpleType>
<xsd:simpleType name="pdbMeth">
<xsd:annotation>
<xsd:documentation>
!IN PDB! The EXPDTA record identifies the experimental technique used. This may refer to the type of radiation and sample, or include the spectroscopic or modeling technique. Permitted values include: ELECTRON DIFFRACTION (ERAY), FIBER DIFFRACTION (FRAY), FLUORESCENCE TRANSFER (FLUOR), NEUTRON DIFFRACTION (NRAY), NMR (NMR), THEORETICAL MODEL (MODEL), X-RAY DIFFRACTION (XRAY)
</xsd:documentation>
</xsd:annotation>
<xsd:restriction base="xsd:string">
<xsd:enumeration value="XRAY"/>
<xsd:enumeration value="ERAY"/>
<xsd:enumeration value="NMR"/>
<xsd:enumeration value="FRAY"/>
<xsd:enumeration value="FLUOR"/>
<xsd:enumeration value="NRAY"/>
<xsd:enumeration value="MODEL"/>
<xsd:enumeration value="N/A"/>
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<xsd:element name="Chain" type="pdbChain" minOccurs="1" maxOccurs="unbounded"/>
</xsd:sequence>
</xsd:complexType>
<xsd:complexType name="pdbChain">
<xsd:annotation>
<xsd:documentation>
CrossRef/PDB/pdbChain is a crossreference to the chain in the given PDB file.
</xsd:documentation>
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<xsd:element name="Fragment" type="fragmentType" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/>
</xsd:sequence>
<xsd:attribute name="ID" type="pdbChainID" use="required"/>
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<xsd:pattern value="[A-Za-z0-9_]"/>
</xsd:restriction>
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<xsd:element name="Sequence">
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<xsd:element name="Cleavable" type="fragmentType" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/>
<xsd:element name="Note" type="xsd:string" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/>
<xsd:element name="Seq" minOccurs="1" maxOccurs="1">
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<xsd:restriction base="xsd:string">
<xsd:pattern value="[ACDEFGHIKLMNOPQRSTVWXY\s]*"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
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</xsd:sequence>
<xsd:attribute name="Checksum" type="Cheksumtype" use="required"/>
<xsd:attribute name="Len" type="seqNum" use="required"/>
</xsd:complexType>
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<xsd:simpleType name="Cheksumtype">
<xsd:restriction base="xsd:string">
<xsd:pattern value="[0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]"/>
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<xsd:element ref="Reference" minOccurs="1" maxOccurs="unbounded"/>
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</xsd:complexType>
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<xsd:element name="Reference">
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<xsd:element name="Journal" type="xsd:string" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
<xsd:element name="Note" type="xsd:string" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/>
<xsd:element ref="AuPred" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
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<xsd:attribute name="PMID" type="PMIDtype" use="required"/>
</xsd:complexType>
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<xsd:simpleType name="PMIDtype">
<xsd:annotation>
<xsd:documentation>PMID</xsd:documentation>
</xsd:annotation>
<xsd:restriction base="xsd:string">
<!--PMUID (USE THIS IF POSSIBLE)-->
<xsd:pattern value="[0-9][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9]"/>
<!-- oldPMUID -->
<xsd:pattern value="[0-9][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9]"/>
<!-- oldPMUID -->
<xsd:pattern value="[0-9][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9]"/>
<!-- topdbID in Ref -->
<xsd:pattern value="[A,B][B,P][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9]"/>
<!-- RegionID in Ref2 -->
<xsd:pattern value="[0-9][0-9][0-9][0-9][0-9]"/>
<!-- PDB_ID in Ref2, if Type/Subtype=Similarity/PDBTM -->
<xsd:pattern value="[1-9][a-zA-Z0-9][a-zA-Z0-9][a-zA-Z0-9][A-Za-z0-9_]"/>
<!--If not PMID-->
<xsd:pattern value="00000000_[0-9][0-9][0-9]"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
<xsd:element name="Membrane">
<xsd:annotation>
<xsd:documentation>
The type and the two sides of the membrane. Syntax (membrane type;inside;outside)
</xsd:documentation>
</xsd:annotation>
<xsd:simpleType>
<xsd:restriction base="xsd:string">
<xsd:enumeration value="Bacterial inner membrane;Cytoplasm;Periplasmic space"/>
<xsd:enumeration value="Bacterial outer membrane;Periplasmic space;Extracellular"/>
<xsd:enumeration value="Bacterial thylakoid membrane;Cytoplasm;Thylakoid space"/>
<xsd:enumeration value="Bacteriophage procoat protein (membrane insertion);Cytoplasm;Periplasmic space"/>
<xsd:enumeration value="Basolateral plasma membrane;Cytoplasm;Extracellular"/>
<xsd:enumeration value="Chloroplast outer membrane;Inter membrane space;Cytoplasm"/>
<xsd:enumeration value="Chloroplast inner membrane;Stroma;Inter membrane space"/>
<xsd:enumeration value="Chloroplast thylakoid membrane;Stroma;Thylakoid space"/>
<xsd:enumeration value="Chromaffin granule membrane;Cytoplasm;Chromaffin"/>
<xsd:enumeration value="Esterosome membrane;Cytoplasm;Esterosome"/>
<xsd:enumeration value="Endoplasmic reticulum membrane;Cytoplasm;Cysternal space"/>
<xsd:enumeration value="Endosome membrane;Cytoplasm;Endosome"/>
<xsd:enumeration value="Flagellar membrane;Flagellum;Extracellular"/>
<xsd:enumeration value="Gas vesicle membrane;Cytoplasm;Vesicle"/>
<xsd:enumeration value="Golgi membrane;Cytoplasm;Cysternal space"/>
<xsd:enumeration value="Lutoid membrane;Cytoplasm;Lutoid particle"/>
<xsd:enumeration value="Lysosomal membrane;Cytoplasm;Lysosome"/>
<xsd:enumeration value="Melanosome membrane;Cytoplasm;Melanosome"/>
<xsd:enumeration value="Microsome membrane;Cytoplasm;Micrsome"/>
<xsd:enumeration value="Micrvillar membrane;Entrance compartment;Extracellular"/>
<xsd:enumeration value="Mitochondrial inner membrane;Matrix;Inter membrane space"/>
<xsd:enumeration value="Mitochondrial outer membrane;Cytoplasm;Inter membrane space"/>
<xsd:enumeration value="Nuclear inner membrane;Inter membrane space;Nucleoplasm"/>
<xsd:enumeration value="Nuclear outer membrane;Cytoplasm;Inter membrane space"/>
<xsd:enumeration value="Nuclear membrane;Nucleoplasm;Cytoplasm"/>
<xsd:enumeration value="Other vesicle membrane;Cytoplasm;Vesicle"/>
<xsd:enumeration value="Peribacteroid membrane;Cytoplasm;Peribacterial space"/>
<xsd:enumeration value="Peroxisomal membrane;Cytoplasm;Peroxisome"/>
<xsd:enumeration value="Plasma membrane;Cytoplasm;Extracellular"/>
<xsd:enumeration value="Prospore membrane;Cytoplasm;Spindle pole body"/>
<xsd:enumeration value="Sarcoplasmic reticulum membrane;Cytoplasm;Cysternal space"/>
<xsd:enumeration value="Synaptic vesicle membrane;Cytoplasm;Lumen"/>
<xsd:enumeration value="Synaptic-like vesicle membrane (SLV);Cytoplasm;Lumen"/>
<xsd:enumeration value="Toxin (membrane pore forming);Unknown;Unknown"/>
<xsd:enumeration value="Trans-Golgi vesicle membrane;Cytoplasm;Cysternal space"/>
<xsd:enumeration value="Unknown membrane;Unknown;Unknown"/>
<xsd:enumeration value="Viral membrane;Matrix;Extracellular"/>
<xsd:enumeration value="Vacuolar membrane;Cytoplasm;Vacuolar lumen"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
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<xsd:element name="Topology">
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<xsd:element ref="Reliability" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
<xsd:element name="Numtm" type="SimpleNumtm" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
<xsd:element ref="Regions" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
<xsd:element name="hmmtop_arguments" type="xsd:string" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
</xsd:sequence>
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<xsd:element name="Regions">
<xsd:complexType>
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<xsd:element name="Region" type="SimpleRegion" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/>
</xsd:sequence>
</xsd:complexType>
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<xsd:element name="Experiments">
<xsd:complexType>
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<xsd:element ref="Region" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/>
<xsd:element ref="Numtm" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/>
</xsd:sequence>
</xsd:complexType>
</xsd:element>
<xsd:element name="Region">
<xsd:complexType>
<xsd:sequence>
<xsd:element ref="Exp" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
<xsd:element name="Note" type="xsd:string" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/>
</xsd:sequence>
<xsd:attribute name="Begin" type="seqNum" use="required"/>
<xsd:attribute name="Min" type="YesNo"/>
<xsd:attribute name="End" type="seqNum" use="required"/>
<xsd:attribute name="Max" type="YesNo"/>
<xsd:attribute name="Loc" type="Localisation" use="required"/>
<xsd:attribute name="ID" type="RegionID" use="required"/>
</xsd:complexType>
</xsd:element>
<xsd:complexType name="SimpleRegion">
<xsd:attribute name="Begin" type="seqNum" use="required"/>
<xsd:attribute name="Min" type="YesNo"/>
<xsd:attribute name="End" type="seqNum" use="required"/>
<xsd:attribute name="Max" type="YesNo"/>
<xsd:attribute name="Loc" type="Localisation" use="required"/>
<xsd:attribute name="TmRun" type="TmRunType"/>
</xsd:complexType>
<xsd:simpleType name="TmRunType">
<xsd:restriction base="xsd:string">
<xsd:enumeration value="io"/>
<xsd:enumeration value="oi"/>
<xsd:enumeration value="oo"/>
<xsd:enumeration value="ii"/>
<xsd:enumeration value="Transit signal"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
<xsd:element name="Numtm">
<xsd:complexType>
<xsd:sequence>
<xsd:element minOccurs="0" maxOccurs="1" ref="Exp"/>
<xsd:element minOccurs="0" maxOccurs="unbounded" name="Note" type="xsd:string"/>
</xsd:sequence>
<xsd:attribute name="Count">
<xsd:simpleType>
<xsd:restriction base="xsd:integer">
<xsd:minInclusive value="0"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
</xsd:attribute>
</xsd:complexType>
</xsd:element>
<xsd:element name="SideDefinition">
<xsd:complexType>
<xsd:sequence>
<xsd:element name="Note" minOccurs="0" maxOccurs="1" type="xsd:string"/>
</xsd:sequence>
<xsd:attribute name="Side1" type="InOrOut" use="required"/>
</xsd:complexType>
</xsd:element>
<xsd:complexType name="SimpleNumtm">
<xsd:attribute name="Count">
<xsd:simpleType>
<xsd:restriction base="xsd:integer">
<xsd:minInclusive value="0"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
</xsd:attribute>
</xsd:complexType>
<xsd:element name="Exp">
<xsd:complexType>
<xsd:sequence>
<xsd:element name="Type" minOccurs="0" maxOccurs="1" type="xsd:string"/>
<xsd:element name="Subtype" minOccurs="0" maxOccurs="1" type="xsd:string"/>
<xsd:element ref="Expdata" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
<xsd:element ref="pdbRef" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
</xsd:sequence>
<xsd:attribute name="Ref" type="PMIDtype" use="required"/>
<xsd:attribute name="Ref2" type="PMIDtype"/>
</xsd:complexType>
</xsd:element>
<xsd:element name="pdbRef">
<xsd:complexType>
<xsd:sequence>
<xsd:element name="Chains" type="pdbChains" minOccurs="1" maxOccurs="1"/>
</xsd:sequence>
<xsd:attribute name="ID" type="pdbID" use="required"/>
</xsd:complexType>
</xsd:element>
<xsd:element name="Expdata">
<xsd:complexType>
<xsd:all>
<xsd:element name="Value" type="xsd:string" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
<xsd:element name="Method" minOccurs="0" maxOccurs="1">
<xsd:simpleType>
<xsd:restriction base="xsd:string">
<!--First letter of the first three (if possible)
authors of the publication of the particular
method (if there are less than 3 author, use X),
and the publication date
-->
<xsd:pattern value="[A-Z]*[0-9][0-9][0-9][0-9]"/>
<!--PMUID (USE THIS IF POSSIBLE)-->
<xsd:pattern value="[0-9][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9]"/>
<!-- oldPMUID -->
<xsd:pattern value="[0-9][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9]"/>
<!-- oldPMUID -->
<xsd:pattern value="[0-9][0-9][0-9][0-9][0-9][0-9]"/>
<xsd:pattern value="Unknown"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
</xsd:element>
<xsd:element name="Approx" type="YesNo" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
<xsd:element name="STD" type="xsd:decimal" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
<xsd:element name="Problem" type="YesNo" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
<xsd:element name="Functional" type="YesNo" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
<xsd:element name="NGlyc" type="YesNo" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
<xsd:element name="His4C" type="YesNo" minOccurs="0" maxOccurs="1"/>
</xsd:all>
</xsd:complexType>
</xsd:element>
<xsd:element name="AuPred">
<xsd:complexType>
<xsd:sequence>
<xsd:element name="Note" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded" type="xsd:string"/>
<xsd:element name="Region" type="SimpleRegion" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/>
<xsd:element name="Numtm" type="SimpleNumtm" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/>
</xsd:sequence>
</xsd:complexType>
</xsd:element>
<xsd:element name="Reliability">
<xsd:simpleType>
<xsd:restriction base="xsd:integer">
<xsd:minInclusive value="0"/>
<xsd:maxInclusive value="100"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
</xsd:element>
<xsd:simpleType name="Localisation">
<xsd:annotation>
<xsd:documentation>
Localization of the particular Residue/Region relative to the membrane. This attribute indicates only the relative position, the correct "biological" side will be replaced by the program, using data from the Membrane tag.
</xsd:documentation>
</xsd:annotation>
<xsd:restriction base="xsd:string">
<xsd:enumeration value="Membrane"/>
<xsd:enumeration value="Inside"/>
<xsd:enumeration value="Outside"/>
<xsd:enumeration value="Unknown"/>
<xsd:enumeration value="Not Inside"/>
<xsd:enumeration value="Not Outside"/>
<xsd:enumeration value="Not Membrane"/>
<xsd:enumeration value="Side1"/>
<xsd:enumeration value="Side2"/>
<xsd:enumeration value="Signal"/>
<xsd:enumeration value="Propeptide"/>
<xsd:enumeration value="Transit"/>
<xsd:enumeration value="Cleavable"/>
<xsd:enumeration value="Membloop"/>
<xsd:enumeration value="Membins"/>
<xsd:enumeration value="Interfacial"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
<xsd:simpleType name="InOrOut">
<xsd:restriction base="xsd:string">
<xsd:enumeration value="Inside"/>
<xsd:enumeration value="Outside"/>
<xsd:enumeration value="Alternate"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
<xsd:complexType name="fragmentType">
<xsd:attributeGroup ref="attlistFragment"/>
</xsd:complexType>
<xsd:attributeGroup name="attlistFragment">
<xsd:attribute name="Begin" type="seqNum" use="required"/>
<xsd:attribute name="End" type="seqNum" use="required"/>
<xsd:attribute name="Type" type="CleavableType"/>
</xsd:attributeGroup>
<xsd:simpleType name="seqNum">
<xsd:restriction base="xsd:integer">
<xsd:minInclusive value="1"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
<xsd:simpleType name="RegionID">
<xsd:restriction base="xsd:string">
<xsd:pattern value="[0-9][0-9][0-9][0-9][0-9]"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
<xsd:simpleType name="YesNo">
<xsd:restriction base="xsd:token">
<xsd:enumeration value="yes"/>
<xsd:enumeration value="no"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
<xsd:simpleType name="CleavableType">
<xsd:restriction base="xsd:token">
<xsd:enumeration value="Signal"/>
<xsd:enumeration value="Propep"/>
<xsd:enumeration value="Transit"/>
<xsd:enumeration value="Fragment"/>
</xsd:restriction>
</xsd:simpleType>
<xsd:simpleType name="organismType">
<xsd:annotation>
<xsd:documentation>
<!--
This enumeration is created by the following steps:
1, wget ftp://ftp.expasy.org/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/complete/docs/speclist.txt
2, grep 'N=' speclist.txt | cut -c 19- | sed -e 's/^/\t\t\t<xsd:enumeration value="/' | sed -e 's/$/"\/>/' > speclist.xsd
3, speclist.xsd is included
-->
</xsd:documentation>
</xsd:annotation>
<xsd:restriction base="xsd:string">
<xsd:enumeration value="Aedes albopictus densovirus (isolate Boublik/1994)"/>
<xsd:enumeration value="Adeno-associated virus 2"/>
<xsd:enumeration value="Adeno-associated virus 2 (isolate Srivastava/1982)"/>
<xsd:enumeration value="Abacion magnum"/>
<xsd:enumeration value="Abaeis niccipe"/>
<xsd:enumeration value="Abax parallelepipedus"/>
<xsd:enumeration value="Abalistes stellaris"/>
<xsd:enumeration value="Abbottina rivularis"/>
<xsd:enumeration value="Antarctic bacterium DS2-3R"/>
<xsd:enumeration value="Abelia chinensis"/>
<xsd:enumeration value="Abelmoschus ficulneus"/>
<xsd:enumeration value="Abelia grandiflora"/>
<xsd:enumeration value="Abelmoschus manihot"/>
<xsd:enumeration value="Abies alba"/>
<xsd:enumeration value="Abies balsamea"/>
<xsd:enumeration value="Abies beshanzuensis"/>
<xsd:enumeration value="Abies bracteata"/>
<xsd:enumeration value="Abies concolor"/>
<xsd:enumeration value="Abiotrophia defectiva"/>
<xsd:enumeration value="Abies firma"/>
<xsd:enumeration value="Abisara fylloides"/>
<xsd:enumeration value="Abies grandis"/>
<xsd:enumeration value="Abies holophylla"/>
<xsd:enumeration value="Abies homolepis"/>
<xsd:enumeration value="Abies koreana"/>
<xsd:enumeration value="Abies lasiocarpa"/>
<xsd:enumeration value="Abies magnifica"/>
<xsd:enumeration value="Abies mariesii"/>
<xsd:enumeration value="Abies nebrodensis"/>
<xsd:enumeration value="Abies sachalinensis"/>
<xsd:enumeration value="Abies veitchii"/>
<xsd:enumeration value="Ablepharus budaki"/>
<xsd:enumeration value="Ablennes hians"/>
<xsd:enumeration value="Ablepharus kitaibelii"/>
<xsd:enumeration value="Australian bat lyssavirus (isolate Bat/AUS/1996)"/>
<xsd:enumeration value="Australian bat lyssavirus (isolate Human/AUS/1998)"/>
<xsd:enumeration value="Abutilon mosaic virus (isolate West India)"/>
<xsd:enumeration value="Acute bee paralysis virus (strain Rothamsted)"/>
<xsd:enumeration value="Abrothrix andinus"/>
<xsd:enumeration value="Abrocoma bennettii"/>
<xsd:enumeration value="Abramis brama"/>
<xsd:enumeration value="Abronia graminea"/>
<xsd:enumeration value="Abrothrix jelskii"/>
<xsd:enumeration value="Abrothrix longipilis"/>
<xsd:enumeration value="Abrothrix olivaceus"/>
<xsd:enumeration value="Abrophyllum ornans"/>
<xsd:enumeration value="Abrus precatorius"/>
<xsd:enumeration value="Abraxas sylvata"/>
<xsd:enumeration value="Absidia glauca"/>
<xsd:enumeration value="Absidia spinosa"/>
<xsd:enumeration value="Abudefduf saxatilis"/>
<xsd:enumeration value="Abudefduf sexfasciatus"/>
<xsd:enumeration value="Abutilon theophrasti"/>
<xsd:enumeration value="Abudefduf vaigiensis"/>
<xsd:enumeration value="Acidianus bottle-shaped virus"/>
<xsd:enumeration value="Acidianus bottle-shaped virus (isolate Italy/Pozzuoli)"/>
<xsd:enumeration value="Abyssocottus korotneffi"/>
<xsd:enumeration value="Acanthophis antarcticus"/>
<xsd:enumeration value="Acanthoscelides argillaceus"/>
<xsd:enumeration value="Acanthospermum australe"/>
<xsd:enumeration value="Acanthurus bahianus"/>
<xsd:enumeration value="Acanthopagrus berda"/>
<xsd:enumeration value="Acanthidops bairdii"/>
<xsd:enumeration value="Acanthocobitis botia"/>
<xsd:enumeration value="Acanthaster brevispinus"/>
<xsd:enumeration value="Acanthopagrus butcheri"/>
<xsd:enumeration value="Acanthaluteres brownii"/>
<xsd:enumeration value="Acanthamoeba castellanii"/>
<xsd:enumeration value="Acanthurus coeruleus"/>
<xsd:enumeration value="Acanthurus chirurgus"/>
<xsd:enumeration value="Acantopsis choirorhynchos"/>
<xsd:enumeration value="Acanthorhodeus chankaensis"/>
<xsd:enumeration value="Acalypha californica"/>
<xsd:enumeration value="Acanthochitona crinita"/>
<xsd:enumeration value="Acacia confusa"/>
<xsd:enumeration value="Acanthosaura capra"/>
<xsd:enumeration value="Acanthosoma crassicaudum"/>
<xsd:enumeration value="Acartia clausii"/>
<xsd:enumeration value="Acantholipes circumdata"/>
<xsd:enumeration value="Acar domingensis"/>
<xsd:enumeration value="Acanthus ebracteatus"/>
<xsd:enumeration value="Acanthodactylus erythrurus"/>
<xsd:enumeration value="Acanella eburnea"/>
<xsd:enumeration value="Acanthoscurria gomesiana"/>
<xsd:enumeration value="Acar gradata"/>
<xsd:enumeration value="Acanthurus guttatus"/>
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<xsd:enumeration value="Aequorivita sublithincola (strain DSM 14238 / LMG 21431 / ACAM 643 / 9-3)"/>
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<xsd:enumeration value="Halothiobacillus neapolitanus"/>
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<xsd:enumeration value="Uncultured bacterium"/>
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<xsd:enumeration value="Haloquadratum walsbyi (strain DSM 16790 / HBSQ001)"/>
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<xsd:enumeration value="Influenza A virus (strain A/Chicken/Hong Kong/715.5/2001 H5N1 genotype E)"/>
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<xsd:enumeration value="Mesorhizobium sp. (strain 7653R)"/>
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<xsd:enumeration value="Mesoplodon stejnegeri"/>
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<xsd:enumeration value="Methylomicrobium alcaliphilum (strain DSM 19304 / NCIMB 14124 / VKM B-2133 / 20Z)"/>
<xsd:enumeration value="Methanococcus aeolicus (strain Nankai-3 / ATCC BAA-1280)"/>
<xsd:enumeration value="Methylomicrobium alcaliphilum"/>
<xsd:enumeration value="Methanosarcina acetivorans (strain ATCC 35395 / DSM 2834 / JCM 12185 / C2A)"/>
<xsd:enumeration value="Metallura aeneocauda"/>
<xsd:enumeration value="Methylocapsa acidiphila"/>
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<xsd:enumeration value="Metarhizium anisopliae"/>
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<xsd:enumeration value="Metarhizium anisopliae (strain ARSEF 23 / ATCC MYA-3075)"/>
<xsd:enumeration value="Methanoregula boonei (strain 6A8)"/>
<xsd:enumeration value="Methanosarcina barkeri"/>
<xsd:enumeration value="Methanosarcina barkeri (strain Fusaro / DSM 804)"/>
<xsd:enumeration value="Methanoculleus bourgensis (strain ATCC 43281 / DSM 3045 / OCM 15 / MS2)"/>
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<xsd:enumeration value="Methanococcoides burtonii (strain DSM 6242 / NBRC 107633 / OCM 468 / ACE-M)"/>
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<xsd:enumeration value="Methylobacterium extorquens (strain CM4 / NCIMB 13688)"/>
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<xsd:enumeration value="Methanosaeta concilii (strain ATCC 5969 / DSM 3671 / JCM 10134 / NBRC 103675 / OCM 69 / GP-6)"/>
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<xsd:enumeration value="Methanosaeta concilii"/>
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<xsd:enumeration value="Methanocella conradii (strain DSM 24694 / JCM 17849 / CGMCC 1.5162 / HZ254)"/>
<xsd:enumeration value="Methylobacterium extorquens (strain ATCC 14718 / DSM 1338 / AM1)"/>
<xsd:enumeration value="Methylobacterium extorquens (strain DSM 5838 / DM4)"/>
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<xsd:enumeration value="Methylobacterium extorquens"/>
<xsd:enumeration value="Methanohalobium evestigatum (strain DSM 3721 / OCM 161 / Z-7303)"/>
<xsd:enumeration value="Methanocaldococcus fervens (strain DSM 4213 / JCM 157852 / AG86)"/>
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<xsd:enumeration value="Methylophaga frappieri (strain ATCC BAA-2434 / DSM 25690 / JAM7)"/>
<xsd:enumeration value="Methylobacillus flagellatus (strain KT / ATCC 51484 / DSM 6875)"/>
<xsd:enumeration value="Methylobacillus flagellatus"/>
<xsd:enumeration value="Methanobacterium formicicum"/>
<xsd:enumeration value="Methanoregula formicica (strain DSM 22288 / NBRC 105244 / SMSP)"/>
<xsd:enumeration value="Methanothermus fervidus (strain ATCC 43054 / DSM 2088 / JCM 10308 / V24 S)"/>
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<xsd:enumeration value="Metasequoia glyptostroboides"/>
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<xsd:enumeration value="Methanospirillum hungatei"/>
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<xsd:enumeration value="Methanotorris igneus (strain DSM 5666 / JCM 11834 / Kol 5)"/>
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<xsd:enumeration value="Methanopyrus kandleri (strain AV19 / DSM 6324 / JCM 9639 / NBRC 100938)"/>
<xsd:enumeration value="Methanocorpusculum labreanum (strain ATCC 43576 / DSM 4855 / Z)"/>
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<xsd:enumeration value="Metacarcinus magister"/>
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<xsd:enumeration value="Methanoculleus marisnigri (strain ATCC 35101 / DSM 1498 / JR1)"/>
<xsd:enumeration value="Methylotenera mobilis (strain JLW8 / ATCC BAA-1282 / DSM 17540)"/>
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<xsd:enumeration value="Methanococcus maripaludis (strain S2 / LL)"/>
<xsd:enumeration value="Methylobacter marinus"/>
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<xsd:enumeration value="Methylobacterium nodulans (strain ORS2060 / LMG 21967)"/>
<xsd:enumeration value="Metachirus nudicaudatus"/>
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<xsd:enumeration value="Methanothermobacter thermautotrophicus (strain ATCC 29096 / DSM 1053 / JCM 10044 / NBRC 100330 / Delta H)"/>
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<xsd:enumeration value="Methanococcus voltae"/>
<xsd:enumeration value="Methanococcus vannielii (strain SB / ATCC 35089 / DSM 1224)"/>
<xsd:enumeration value="Methanothermobacter wolfeii"/>
<xsd:enumeration value="Methanosalsum zhilinae (strain DSM 4017 / NBRC 107636 / OCM 62 / WeN5)"/>
<xsd:enumeration value="Mink enteritis virus (strain Abashiri)"/>
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<xsd:enumeration value="Murid herpesvirus 4"/>
<xsd:enumeration value="Musca hytrovirus(isolate Musca domestica/United States/Boucias/-)"/>
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<xsd:enumeration value="Miarus fennicus"/>
<xsd:enumeration value="Micrarchaeum acidiphilum"/>
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<xsd:enumeration value="Micrurus tener tener"/>
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<xsd:enumeration value="Mnemiopsis leidyi"/>
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<xsd:enumeration value="Psychrobacter arcticus"/>
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<xsd:enumeration value="Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009)"/>
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<xsd:enumeration value="Rothia hirsuta"/>
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<xsd:enumeration value="Rothschildia orizaba"/>
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<xsd:enumeration value="Saccharopolyspora erythraea"/>
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<xsd:enumeration value="Scaevola aemula"/>
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<xsd:enumeration value="Zygosaccharomyces bailii (strain CLIB 213 / ATCC 58445 / CBS 680 / CCRC 21525 / NBRC 1098 / NCYC 1416 / NRRL Y-2227)"/>
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<xsd:enumeration value="Zygogeomys trichopus"/>
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<xsd:enumeration value="Zymomonas mobilis subsp. mobilis (strain NCIB 11163)"/>
<xsd:enumeration value="Zymomonas mobilis subsp. mobilis (strain ATCC 31821 / ZM4 / CP4)"/>
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<xsd:enumeration value="Zymomonas mobilis subsp. pomaceae (strain ATCC 29192 / JCM 10191 / NBRC 13757 / NCIMB 11200 / NRRL B-4491)"/>
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